Ciencia virtual: medicinas que nacen en la computadora




Jean Cui, centro, usó análisis computarizado para crear un tratamiento contra un tipo de cáncer.

Tras décadas buscando componentes en la naturaleza con potencial medicinal, hoy la mayoría de las farmacéuticas más destacadas está diseñando medicamentos de manera virtual. Gracias a análisis computarizados poderosos, los científicos manipulan las moléculas en las pantallas de sus computadoras para crear compuestos a la medida que ataquen las proteínas que causan enfermedades.

Este método de confección de moléculas es llamado diseño por estructura. La técnica fue usada para crear Xalkori, un tratamiento que Pfizer Inc. lanzó el año pasado para una forma rara y resistente de cáncer de pulmón. El fármaco también ha sido empleado en un tratamiento para Alzheimer desarrollado por Eli Lilly & Co., un antibiótico fabricado por GlaxoSmithKline PLC y un descoagulante de Sanofi SA.

Las farmacéuticas están encontrando tratamientos que nunca hubiesen descubierto de otra manera, dice Magid Abou-Gharbia, director del Centro de Descubrimientos de Drogas de la Universidad de Temple.

El diseño es muy distinto a las técnicas tradicionales de desarrollo de fármacos, dice Jean Cui, la investigadora responsable de Xalkori.

Normalmente, una medicina ataca la proteína que está causando la enfermedad, y que interactúa con otras moléculas de una manera nociva. El medicamento hace contacto con la proteína y puede detenerla, restaurando así las reacciones saludables o compensando las enfermizas.

Por años, las farmacéuticas han acumulado vastas bibliotecas de compuestos y utilizado robots para que generen cientos de miles de muestras que les permitan descubrir si alguna tenía algún potencial médico. Sin embargo, casi todo se dejaba a la suerte. Los investigadores descubrían una nueva medicina pero no sabían cómo o por qué funcionaba. No sabían cómo lucían las llaves ni las cerraduras.

Determinar la forma de una cerradura no es fácil. Las proteínas se escapan de los rayos X por lo que sus imágenes no pueden ser captadas. Los científicos necesitan cristalizarlas para que no se disipen y entonces deducir su forma a partir de los trazos dejados en los rayos X. Este proceso requiere miles de modelos de interferencia y de computadoras potentes para analizarlos.

Los investigadores luego deben diseñar una molécula que encaje en esa cerradura, lo que es un reto. Además, la molécula debe conectar con el blanco y no puede ser metabolizada por el cuerpo ni demasiado despacio ni demasiado rápido, y tiene que ser capaz de ser sintetizada y fabricada en grandes cantidades.

Por todos estos desafíos, el diseño por estructura es más un instrumento para aumentar los descubrimientos que para revolucionarlos. Este procedimiento provee información útil y a veces crucial para el hallazgo de nuevos fármacos, pero no puede generar el candidato ideal sin información y trabajo adicional.

Según Pfizer, Xalkori no habría sido descubierto a principios de la década pasada sin el diseño por estructura. Sus científicos habían identificado la molécula c-Met, que jugaba un papel importante en el crecimiento de tumores de cáncer. Con la nueva técnica, cristalizaron la c-Met con uno de los prototipos de moléculas, le tomaron rayos X y, utilizando computadoras, dedujeron la estructura de la proteína y cómo el prototipo encajaba en ella como una llave en una cerradura.

Los investigadores enviaron los resultados a Cui, quien se dedicó a buscar una nueva molécula que bloquease la proteína c-Met y tuviese las características convenientes para un fármaco. Fue difícil, recuerda Cui. La nueva molécula tendría que encajar en un sitio de la proteína c-Met que los científicos no esperaban, y que requería una compresión en un espacio más pequeño. Cui se sentía dentro de un rompecabezas.

En mayo de 2002, después de cinco meses estudiándolo, Cui al fin visualizó el diseño. Sus colegas se encargaron de fabricar compuestos de manera virtual en la computadora, y en tubos de ensayo para estudios posteriores. En febrero de 2003, pruebas en animales demostraron que la molécula podía parar el crecimiento del tumor. Los científicos refinaron, sintetizaron y estudiaron la molécula hasta que Xalkori se volvió apto para ser probado en humanos.

El trabajo mostró que Xalkori se adhería y bloqueaba la proteína llamada ALK que causaba actividad tumoral y también la c-Met. Xalkori fue aprobado el año pasado para el tratamiento de cáncer de pulmón de células no pequeñas causado por un problema genético que afecta la ALK. Su uso en otros cánceres en los que la proteína c-Met está implicada sigue bajo investigación.

Fuente: The Wall Street Journal

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